En 1998, cuando se inició el proyecto de conservación y protección del Alto de San Miguel, el registro de biodiversidad reportó 124 especies de aves; actualmente se encuentran 241 especies, entre residentes y migratorias. Los habitantes de la vereda La Clara ayudan a proteger la reserva forestal sirviendo como guías y guardabosques.

El proyecto de conservación y protección es promovido por la Alcaldía de Medellín y se realiza en lugares estratégicos como los cerros tutelares, áreas protegidas, fuentes hídricas que abastecen acueductos rurales y urbanos, además del Alto de San Miguel y el Jardín Circunvalar. Las Universidades CES y Nacional han sido las encargadas del seguimiento de las especies de aves en el Alto durante los últimos 20 años.

El Alto de San Miguel fue declarado reserva forestal protegida en 2016, su tamaño es de 1.622 hectáreas. En él se alberga el 16% de la biodiversidad reportada en el país y el 27% de especies de aves registradas en Antioquia.